﹐迫使革命党人放弃了建都南京的主张。3月﹐袁推唐绍仪出任国务总理﹐抵南京组织新内阁﹐接收临时政府。4月1日﹐政府迁往北京，革命党人用无数鲜血和人命争取带的中华民国政权全部落到了袁世凯的手中。
南京临时政府北迁之后，革命党人努力保留南京留守这个中心。黄兴改任南京留守，统辖南洋各军。他成立留守府，以李书城为留守府总参议，府内设政务、军务两厅，以马相伯为政务厅厅长，张孝准为军务厅厅长，陈嘉会为秘书长，何成浚为总务处处长，耿觐文为参谋处处长，曾昭文为军需处处长，陈登山为军法处处长，赵正平为军学处处长，林虎为警卫团团长。
黄兴将南京各省民军暂编为5个军，即柏文蔚的第一军，徐宝山的第二军，王芝祥的第三军，姚雨平的第四军，朱瑞的第五军。而就在黄兴在任留守的第6天，赣军因军饷不足发生兵变，焚掠白门桥、太平桥一带。兵变发生时，黄兴正在上海同唐绍议洽商公务，闻讯急忙搭夜车回南京，至天明，兵变已被驻守的其余各部平定。
柏文蔚现在心头可是苦涩得紧，手下有过万兄弟都跟着他一起吃饭，可是他又没有一块稳定的革命根据地，不跟王进这个大财主打好关系可不成
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