辅佐袁崇焕

宁远大战时，孙元化立下大功，孙元化运用所学使西洋大炮的作用发挥到了极致，几乎达到了百发百中的地步。宁远大捷后，孙元化深受袁崇焕赏识，在袁崇焕的举荐下，孙元化开始崭露头角。

其后，孙元化奉调回京任职，但不久就因不肯附逆阉党而被去职。崇祯登基后，被阉党罢黜的官员相继重新被启用，孙元化也在其中。

今年一月，孙元化随孙承宗出关；三月，朝廷加孙元化为山东按察副使；五月，经兵部尚书梁廷栋破格提拨，孙元化升为登、莱二州巡抚。

梁廷栋之所以破格提拔孙元化，是因为皮岛，因为副将刘兴治作乱，杀了副总兵陈继盛等十余人。孙元化上任不久，刘兴治被杀，孙元化保举登州总兵黄龙镇守皮岛。

廖南无提到孙元化，不仅仅是因为孙元化是最好的火炮专家，也不仅仅是因为孙元化手中有大量的战舰，更是因为两个人：孔有德和耿仲明。