于“青铜树”事件发生半年后再次登场，并且在期间制造了惊动喰种界的“七区喰种餐厅屠杀”事件。因为大量的共喰加上不停的锻炼，使得金木的实力得到飞速提升。
在了解了一系列关于“青铜树”组织的消息后，为了进一步接近事情的真相和了解自己成为喰种的缘由，与月山和数一等捕获了A女士并前往将自己改造为“喰种”的嘉纳医生的居住地进行调查，途中遭遇了青铜树的攻击。与月山，数一等人分头后，金木再次遇到了青铜树的人——原6区首领，从食尸鬼关押区逃出的SS级喰种“鯱”，并与之进行战斗，因实力差距使得金木被击败，随后突遇嘉纳医生，心中突激起各种感情的金木想要把嘉纳医生带走，却被嘉纳医生放出的大量不成品的半人半喰种“实验体”困住，战斗中将所有实验体吞噬并成为了“半赫者”。
之后遭遇CCG喰种搜查官并展开战斗，寡不敌众与神志不清的原因使得金木最终被搜查官联合击败；但由于双方都伤亡惨重，战斗就此终止；此战斗中金木被CCG定级为“SS级喰种”，并被特等搜查官篠原幸纪评价“在我所见过的喰种中，你是最疯狂的一个”。
嘉纳医生事件调查未果的金木选择了前往古董咖啡店向芳村店长询问更多关于“青铜树”组织的信息，随后从店长口中得知青铜树组织成立的契机是因为芳村店长的孩子“独眼的枭”。
了解更多信息并进行了大量思想斗争的金木最终决定带领自己的小队重新回到“古董”咖啡厅，然而此时的金木并不知道，古董已被CCG喰种搜查官组织悄然盯上，并展开了大规模针对芳村店长的“枭”讨伐计划。在讨伐当天从大屏幕看到现场情况的金木震惊不已。
由于店长是SSS级喰种，因此此次讨伐规模异常庞大；为不让自己的同伴陷入危险，金木决定独自一人孤身前往现场协助古董作战；月山习得知后欲用武力阻止金木前往，称“那个规模，就算是整个月山家出动也是以卵击石”，却被下定决心的金木瞬间制服后放弃阻止。
到达现场后展开战斗姿态的金木一击破坏了准特等搜查官钵川的库因克并使其彻底丧失战斗力，拯救了差点被杀死的古董成员入见萱并将其安置；随后金木一人在众搜查官分队中穿梭自如并破坏了众多搜查官的库因克，使其失去战斗能力后继续前进，过程中再次救下了险些丧命的古董成员古间，并仅以一击破坏了特等搜查官田中丸望元的库因克。
安置完古董同伴的金木研决定顺势一口气前往芳村店长的战斗阵地。途中再次与亚门钢太郎相遇，并再次暴走成为半赫者，意识错乱中斩断了亚门的一只胳膊。两败俱伤而逃走。在下水道内遇到儿时的伙伴——永近英良，逃出下水道后遇到食尸鬼搜查官有马贵将，被刺穿左眼后仍不停止战斗，最终在与有马贵将的战斗中失败，
被刺穿双眼。回忆起以前妈妈的事情，白发金木与黑发金木融合，当初是一个戴小丑面具的喰种弄断钢筋将神代利世砸成重伤。已得知“独眼之枭”为高槻泉CCG库因克斯班一等搜查官（佐佐木绯世），目前失忆。
在枭驱逐战之中金木失去了记忆，有马贵将给金木取了佐佐木琲世的名字，而ccg总议长和修常吉让金木带领库因克斯班的瓜江久生、不知吟士、六月透和米林才子。
在成为搜查官一段时间后获得了白单翼奖（单独驱逐s级喰种才会获得的奖项）。对于现在的”佐佐木“来说有马贵将则是自己的父亲，而真户晓则是自己的母亲一般。
”佐佐木“同样喜欢看书，并且还将自己的书借给有马。而已经成为准特等的铃屋什造认出了”佐佐木“为金木，将偷走的金木的钱包还给了他，每次见面”佐佐木“都会在口袋里面准备食物给什造，而什造也十分关心金木。
同时佐佐木常常会在精神世界中遇到”白金木“，但却很抵触其的力量，不愿接受其的力量。
一开始金木和下口班合作抓捕一个名为Torso的喰种，而”佐佐木“前往喰种收容所与神父多奈托·普鲁普拉见面得到了神父的建议帮助，并且神父还邀请”佐佐木“下一次见面商谈重要的事情。瓜江久生和不知吟士抓捕小林昭之时，”佐佐木“害怕自己的部下出事而赶来，但阻止了瓜江杀害他。
瓜江抓捕Torso遭遇大蛇，”佐佐木“赶到救了瓜江。与大蛇交手，先被贯穿肚子，让部下原地待机再次调整状态后将大蛇贯穿身体击败，大蛇确认是西尾锦，西尾锦说出金木研的名字使得”佐佐木“暴走，被平子丈班带回CCG，之后”佐佐木“撤销瓜江久生班长的身份，让不知吟士接任新的班长。
在外出喝咖啡时再遇雾岛董香，但此时其由于失忆并未认出董香来。后又见到了四方莲示。在喝完董香的咖啡后情不自禁流下眼泪，并发觉了董香虽在微笑着，但且有着些许的哀伤。后“佐佐木”在心里暗想”原来有这样美丽的人
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