最后诏拜征西将军皇甫嵩为车骑将军，并以其为主，北军中候王斌、羽林中郎将徐荣等人为副，统率长安各军负责守卫城池。赵谦为表支持，主动将手下四千益州叟兵交了上去，这支叟兵是由叟人组成的军队，以勇敢善战著名，曾借此镇压白波黄巾。
这样再加上皇甫嵩手下两千余人，建义中郎将段煨手下万余人，以及护羌校尉杨儒招募的三千新兵、荀攸与皇甫郦前往左冯翊以财物说来助战的数千羌胡义从，长安可勉强拉起一支将近四、五万人的队伍。
此事过后，还引起一阵余波，长安市民在甫一开始听到王允被捕入狱后，在有心人的挑唆下舆情纷扰，险些闹出事端。
皇帝为了安定城内百姓，命京兆尹司马防内松外紧，逐一排查，在处决了几个寻衅滋事的恶徒、以及秘书丞王凌改任长安令现身说法以后，长安才逐渐开始安定。