是军机处，这是管军事的，严格要求行政不得干预军事，军事不得干预行政。
全国六部，其中两个换了名字，撤销工部，改为科学院，也就是说，以后所有军事上或者是农事上的制造，都不再有工部打包承揽，而直接向民间采购，工部，只负责集合全国最优秀的工匠，进行新的科学技术研发。
第二个，将礼部换名为教育部，职能不变，但性质却变了，在教化民力的时候，更偏重于整合整个大明的教育体系。
增加了工商部，一个是管理工商业主，同时兼职税务，开始向全天下的工商业者征收税赋，从而增加整个国库的收入，降低土地租税的份额，减少百姓的负担。