以外，还有蜘蛛、蜈蚣和昆虫幼蛹等。土壤里这些居民活动的结果，使土壤中充满了空气，并促进了水分在整个植物生长层的流动。这里面蚯蚓是土壤里的重要居民，它把尚未腐化的植物残体连同土壤一起吃进去，而排出的是掺混了有机物的肥土，排泄物中的钙质等被浓缩后，对酸性土壤具有改良作用。有机体通过蚯蚓的消化管道被分解，土壤借助其排泄物变得更加肥沃。另外，因为蚯蚓在食用土壤和腐殖质的同时还在土壤中活动，所以土壤的孔隙有所增加，从而使土壤排水和空气流通良好。据统计，由蚯蚓所翻松的土量，每1000平方米每年可达38～55吨。土壤是由一个生命之网所组成的综合体，在这儿，生物依赖于土壤，反过来，只有当这个生命综合体繁荣兴旺时，土壤才能成为地球上一个生机勃勃的部分。”
那位白发专家对李志刚说：“这样跟你说吧，如果用极端一些的说法来形容的话，目前地球上的土壤已经严重退化，和月球上的土壤没有太大的差别，都是没有生命的。”
“土壤死了！这是咱们事先没有考虑到的事情！”那位眼镜专家忧心忡忡地说。
“啊！怎么会这样？”那几名助手都惊叹道。
李志刚心中一阵狂跳，眼前一阵阵发黑。自己在凤凰山溶洞宾馆发现所有植物全部死亡后，曾经有过这种感觉。如今四个多月过去了，通过自己和大伙的共同努力，稻种也弄到手了，社会秩序也基本有所恢复，联盟也初步规模，本想甩开膀子大干一场，却被这两位专家迎头泼了一盆凉水，真是“晶晶亮、透心凉”
难道今后地球的环境真的变得这样糟糕？李志刚心乱如麻，脑海里不由得浮现了这样的景象：
…两位农业专家的预言果然变成现实，尽管体育场稻田试验取得成功，但也是在人工改变土壤结构后才实现的。因风沙影响，北方大区建设中无法在室外进行农作物种植。当道南方大区建设开始后，人们惊恐地发现，从联盟带来的稻种根在那些已经死亡的土壤中生长得十分缓慢，甚至无法完成整个生长周期，按灾难发生前的种植方法只能是颗粒无收。没有办法，人们只能在土壤里面加入各种改良剂，埋入通风管，就像给病人安装呼吸机和生命维持仪一样，强行行持着土壤的生命，勉强收获一些农作物。
但由于人口数量有限，这种改良只能只能是极小范围的，对于广袤的大地来说作用是微乎其微。野生植物越来越少，只能局限于当时没有被伽玛射线袭击过的地方，无法向其他地区蔓延。没有植物的覆盖，大地继续是一片萧条。即便是蔡同荣他们那边，也逐渐变成一个荒凉的、没有任何生物在野外活动的野岛。气候也越来越糟糕，各种极端天气频现。
几年后，幸存者们的外部生活环境明显恶化。走出室外，到处都是一片荒凉，风沙肆虐，昔日的土地都板结变硬，生物无法在上面存活，也无法进行人工改良。人们只能生活在室内，农作物只能在体育馆内种植，日常活动也限于室内。又过了几年，地球环境极度恶化，室外彻底变成了不毛之地。气候也更加异常起来，要么就是烈日当空，要么就是大雨倾盆。由于地面植物都无法恢复，土壤结构也失去了涵养水分的功能，大雨一到，洪水就开始泛滥，低洼处一片泽国。蔡同荣等人又重新退缩到基地内。李志刚这边的一部分人也要重新回到凤凰山宾馆。其余的则只能躲在大型体育场内，成为真正的‘穴居动物’。
由于农业文明进程停滞不前，幸存者重新恢复工业文明的梦想彻底破灭，跨地域的融合停止了，人们的活动范围越来越少。外出活动的主要内容就是收集各种灾难发生前遗留下来的生物物资。随着自然环境温度的骤升骤降，这些遗留物资也在迅速老化失效，高分子制品基本上都不能够使用了，金属制品也是锈迹斑斑。
十几年后，幸存者的后代开始长大，他们因为未成年而不能获准到地面上去，寂寞难耐，只能在洞穴里面看录像节目解闷。灾难前留下的种种节目内容都如同在外星上发生的事情似的，他们无法理解在录像中那种旷野中的恬静，只好从室内种植的农作物中想象父辈们口中关于灾前地球环境的样子，所有的自然之美都变成了永远的传说，室外就是如同外星一样，昼夜温差巨大，气候反复无常，飓风、洪水更是家常便饭。所有没有利用的建筑都被这种恶劣的环境弄的土崩瓦解，破烂不堪，杂物随着飓风到处飘扬，整个地球就像一个大垃圾场。
幸存者可以利用的人工建筑也开始进入迅速衰老期，会展中心、大型体育场这些适合种植农作物的地点破损的地方越来越多，幸存者们为修补而整日疲于奔命、战战兢兢。外出活动的风险越来越大，许多人都会被突如其来的暴风刮走丢掉性命。为了未来生存着想，人们开始修建地下城堡。各大中心城市里面的人防设施成为根据地，并在此基础上不断扩展，相继修建了大型的地下农作物种植基地，依靠人工阳光来从地面引入并过滤后的空气提供给农作物生长所必须的原料。
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