萨耶夫产生了一个大胆的想法。他认为通古斯大爆炸是一艘外星人驾驶的核动力宇宙飞船，在降落过程中发生故障而引起的一场核爆炸。
不过此论一出，立即在当时苏科学界引起了强烈反应。支持者和反对者不乏其人。索罗托夫等人进一步推测该飞船来到这一地区是为了往贝加尔湖取得淡水。还有人指出，通古斯地区驯鹿所得的癞皮病与老美与1945年在新墨细哥进行核测验后当地牛群因受到辐射引起的皮肤病十分近似。而通古斯地区树木生长加快，植物和昆虫出现遗传性变异等情况，也与老美在太平洋岛屿进行核试验后的情况相同。
到了五、六十年代，苏科学院多次派出考察队前往通古斯地区考察。认为是核爆炸的人和坚持“陨星说”的人都声称考察找到了对自己有利的证据，双方谁也说服不了谁。对于没有找到中心陨星坑的情况，有人认为坠落的是一颗彗星，因此只能产生尘爆，而无法造成中心陨星坑。
1973年，一些老美科学家对此提出了新见解，他们认为爆炸是宇宙黑洞造成的。某个小型黑洞运行在冰岛和纽芬兰之间的大西洋上空时，引发了这场爆炸。但是关于黑洞的性质、特点，人们所知甚少。“小型黑洞”是否存在尚是疑问。因此，这种见解也还缺少足够的证据。直到今天，关于通古斯大爆炸之谜仍没有解开。